Idanwo metylation ni idapo pẹlu awọn fonutologbolori fun iboju iboju ti awọn ète ati ibojusin lukimia pẹlu deede ti 90.0%!

Wiwa ti akàn ti o da lori biopsy omi jẹ ile-iṣọpọ tuntun ti iwa-afẹde ti akàn ti AMẸRIKA ni awọn ọdun aidọgba ni kutukutu, pẹlu ero ti ṣawari akàn ni kutukutu. O ti wa ni lilo pupọ bi biomarker fun aisan ni kutukutu ti awọn Majezigncies pupọ, pẹlu aguns lung, awọn eegun eegun, gliomas ati awọn eegun domimas ati diamotomos ati awọn eegun-ikawe.

Awọn ifarahan ti awọn iru ẹrọ lati ṣe idanimọ ala-ilẹ methylgas (methylake) biomarkers ni agbara lati wa iboju akọkọ ti o wa fun cerer, fi awọn alaisan si ipele ti itọju ti a ṣe itọju akọkọ.

Laipẹ, awọn oniwadi ti ni idagbasoke iru ẹrọ ti o rọrun ati taara taara fun snopartivis ti ile-ilẹ ti o da lori cystemine ti a ṣe ọṣọ pẹlu cysterils ti o dara julọ ti o ni ibamu pẹlu iboju to wa ni apapọ awọn ènìto. Iboju ni kutukutu fun a le ṣe laarin awọn iṣẹju 15 lẹhin isediwon DNA lati awọn ayẹwo ẹjẹ kan, pẹlu deede ti 90.0%. Akọle akọle ti nkan ti DNA ti akàn ni ẹjẹ eniyan nipa lilo awọn ohun elo cystemine ati foonuiyara iṣẹ-ṣiṣe.

Nọmba 1

Eyi han ni Aworan 1. Ni akọkọ, a lo ojutu olomi lati tu awọn oṣó DNA. Cyst / AuPS ni a ṣafikun lẹhinna ṣafikun ojutu ti o papọ. DNA ti o jẹ deede ati mabigtant ni awọn ohun-ini methylys oriṣiriṣi, eyiti o jẹ awọn apa DNA pẹlu oriṣiriṣi awọn ilana apejọ ara ẹni. Idaraya DNA Desely ati nikẹjẹ awọn ilana cyst / Ayanp, eyiti o jẹ atunṣe ninu awọ lati pupa si eleyi ti a le ṣe akiyesi pẹlu oju ihoho. Ni ilodisi, profaili methyllas alailẹgbẹ ti dna akàn ti akàn nyorisi iṣelọpọ ti awọn iṣu nla ti awọn oṣó DNA.

Awọn aworan ti 96-sókè dè ni a mu kamẹra kamẹra kan. Akàn DNA ni a ṣe iwọn nipasẹ foonuiyara ti o ni ipese pẹlu ẹkọ ẹrọ ti a ṣe afiwe si awọn ọna ti o da lori awọn ọna ti o da lori.

Ṣiṣere akàn ni awọn ayẹwo ẹjẹ gidi

Lati fa ohun elo ti oye ti o ni imọlara, awọn oniwadii lo sensọ kan ti o ṣe aṣeyọri ṣaṣeyọri laarin awọn ayẹwo ẹjẹ gidi. Awọn apẹẹrẹ methylation ni CPG n wa edigeeneticategica ṣe agbekalẹ ọrọ ara. Ni fere gbogbo gbogbo awọn oriṣi akàn, awọn ayipada ni ọjọ membysy ati nitorinaa ninu ikosile ti awọn jibu ti a ti ṣe akiyesi si idakeji.

Bii awoṣe fun awọn aarun kekere miiran ti o ni nkan ṣe pẹlu methylasation ẹjẹ, awọn oniwadi lo awọn alaisan ẹjẹ Lekomia ati awọn iṣakoso ilera lati ṣe iwadii ipa ti ile-iṣẹ methyli ti ni iyatọ awọn aarun kekere. Awọn ọna kẹmika yii Methycher kii ṣe awọn ọna iboju ti o wa nikan, ṣugbọn tun ṣafihan iṣeeṣe ti fifa si wiwa ti ọpọlọpọ awọn alakan ti o rọrun ati taara ati taara.

DNA lati awọn ayẹwo ẹjẹ lati awọn alaisan 12 Leukomia ati awọn eniyan 12 ti o ni ilera ti ni atupale. Gẹgẹbi o han ninu idite apoti ni Nọmba 2A, mimu ibatan ti awọn ayẹwo akàn (δa650 / 525) kere ju ti DNA lọ si awọn ayẹwo deede. Eyi jẹ nipataki nitori hydrophobicity hydrophobicity ti o ni imudara si apejọ ipo ti akàn DNA, eyiti o ṣe idiwọ fun ipin ti cyst / Aups. Bi abajade, awọn ẹwẹna wọnyi ti tuka patapata ninu awọn fẹlẹfẹlẹ ti o wa ti awọn akojọpọ akàn, eyiti o yorisi pipinpinpin iyatọ ti cyst / AunPs Asorsed deede ati awọn apejọ Dna Asoro. Awọn ohun elo ROC lẹhinna ti ipilẹṣẹ nipasẹ iyatọ iyatọ lati iye ti o kere ju ti δa650 / 525 si iye ti o pọju.

Nọmba 2. (a) Awọn iye ibatan nipasẹ awọn solusan ti cyst / Aumput ti n ṣafihan niwaju deede (buluu) ati akàn (Red) DNA labẹ awọn ipo iṣapeye

(Da650 / 525) ti awọn igbero apoti apoti; (b) Onínọmbà ROC ati igbelewọn ti awọn idanwo ayẹwo. (C) Iralu Matrix fun iwadii aisan ti deede ati akàn. (D) Ifarabalẹ, iye asọtẹlẹ asọtẹlẹ (PPV), iye asọtẹlẹ asọtẹlẹ ti odi (NPV) ati deede ti ọna ti o ni idagbasoke.

Gẹgẹbi o ti han ninu olukatika 2B, agbegbe labẹ ohun ti o ni Roc (AUC = AUC = 0.9274) ti a gba fun sensọ ti o dagbasoke fihan ifamọ giga ati alaye pataki. Gẹgẹbi a le rii lati inu apo-iwe apoti, itọkasi ti o kere julọ ti o nso aṣoju ẹgbẹ DNA deede ko ni sọtọ lati ojuami DNA ti o ga julọ; Nitorinaa, o ti lo winying itan lati ṣe iyatọ laarin awọn ẹgbẹ deede ati akàn. Fi fun awọn oniyipada ololusa ti ominira, o ṣe iṣiro iṣeeṣe ti iṣẹlẹ ti o waye, gẹgẹbi akàn deede kan. Awọn sakani oniyipada ti o gbẹkẹle laarin 0 ati 1. Abajade jẹ nitorina iṣeeṣe. A pinnu iṣeeṣe ti idanimọ idanimọ alakan (p) da lori δa650 / 525 bi atẹle.

Nibo B = 5.3533, W1 = -6.965. Fun ipinsẹ ayẹwo, iṣeeṣe kan ti o kere ju 0.5 tọkasi apẹẹrẹ deede, lakoko iṣeeṣe ti 0,5 tabi ti o ga julọ tọka si ayẹwo akàn. Nọmba 2C ṣe afihan ipo rudurudu Matrix ti ipilẹṣẹ lati Fifagile-I-Alaaye nikan, eyiti a lo lati fi idi iduroṣinṣin mulẹ ti ọna ipinya. Nọmba 2D Ṣe akopọ atunyẹwo idanwo iwadii ti ọna naa, pẹlu ifamọra, ni pato, iye asọtẹlẹ to daju (PPV ati asọtẹlẹ asọtẹlẹ odi (NPV).

Awọn ile-iwe ti o da lori foonuiyara

Lati yipada si irọrun ayẹwo ayẹwo ti ko tọ laisi lilo awọn iwoye ti o lo, awọn oniwadi lo ẹkọ atọwọda gẹgẹbi oye ti ojutu ati ṣe iyatọ laarin awọn eniyan deede ati awọn alade. Fun eyi, oju kọnputa ni a lo lati tumọ awọ ti cyst / Aunp ojutu kan si DNA (eleyi ti DNASOUP) ni lilo awọn aworan ti 96-daradara ti a mu nipasẹ kamẹra foonu alagbeka ti o ya. Itoju Oríkì le dinku awọn idiyele ati imudarasi wiwọle si ni itumọ awọ ti awọn solusan nanoparticle, ati laisi lilo eyikeyi awọn ẹya ẹrọ foonu flatware. Lakotan, awọn awoṣe ikẹkọ meji, pẹlu igbo airotẹlẹ meji (RF) ati ẹrọ Fector (SVM) ni oṣiṣẹ lati ṣe awọn awoṣe. Mejeeji awọn awoṣe RVM ati awọn awoṣe SVM ni deede jẹ ami awọn ayẹwo bii rere ati odi pẹlu deede ti 90.0%. Eyi daba pe lilo ti atọwọda atọwọda ni ibi-aṣẹ orisun foonu alagbeka jẹ ṣee ṣeeṣe.

Nọmba 3. (a) kilasi ti a fojusi ti ojutu ti o gbasilẹ lakoko igbaradi ti apẹẹrẹ fun igbesẹ rira Aworan. (b) Apẹẹrẹ aworan lakoko igbese rira Aworan. (c) Ipa awọ ti cyst / Aunpp ojutu ni kọọkan daradara ti awo 96-daradara fa jade lati aworan (b).

Lilo Cyst / AunPs, awọn oniwadi ti ṣaṣeyọri ni idaabobo aabo ti ko rọrun fun DNA ala-kẹmika ti o lagbara lati ibi-akọọlẹ ẹjẹ gidi fun ibojusin idoti. Sensọ ti o dagbasoke ṣe afihan pe DNA jade kuro ninu awọn ayẹwo ẹjẹ gidi ni anfani lati yarayara ati awọn idiyele-idiyele ti akàn ni iṣẹju mẹẹdogun ti 95.3%. Lati yipada si iṣẹlẹ ayẹwo ayẹwo nipa imukuro iwulo fun sconrophotopeter, ẹkọ ẹrọ ti a lo lati tumọ awọ ti ojutu ati awọn eniyan alataja ni lilo aworan alagbeka ati deede ni tun le waye ni 90,0%.

Itọkasi: DA: 10,1039 / D2ra05725E