Àmì Tuntun fún Ìyọkúrò DNA Omi Ayika — Ìtẹ̀léra Bigefei Yí Ìwádìí Sáyẹ́ǹsì Dára Síi

Ọ̀nà Èédú Magnetic ń yanjú àwọn ìpèníjà nínú yíyọ DNA kúrò nínú omi àyíká dáadáa

Ní àwọn ẹ̀ka bíi ìwádìí nípa àwọn ohun alààyè àti ìmójútó ìbàjẹ́ omi, yíyọ DNA onípele gíga jáde jẹ́ ohun pàtàkì fún àwọn ohun èlò ìsàlẹ̀ pẹ̀lú PCR/qPCR àti ìtẹ̀léra ìran tuntun (NGS). Síbẹ̀síbẹ̀, àwọn àpẹẹrẹ omi àyíká jẹ́ ohun tó díjú gan-an, tí ó ní onírúurú àwọn agbègbè onípele, àwọn irúgbìn líle koko bíi bakitéríà Gram-positive, àti àwọn ìpèníjà tó ti pẹ́ tí ó ní í ṣe pẹ̀lú àwọn ọ̀nà ìyọkúrò ìbílẹ̀—bíi lílo àwọn ohun èlò olóró àti àwọn ìlànà díjú—tí ó ti ń yọ àwọn olùwádìí lẹ́nu nígbà gbogbo.

Ní báyìí, Bigfish Sequencing ṣe àgbékalẹ̀ BFMP24R Magnetic Bead-Based Environmental Water Genomic DNA Extraction and Purification Kit, èyí tí ó ń pèsè ojútùú pípé sí àwọn ìpèníjà wọ̀nyí nípasẹ̀ ìmọ̀ ẹ̀rọ tuntun àti àwòrán tí ó rọrùn láti lò.

Àkótán Ọjà

640

Ohun èlò yìí dá lórí ètò ìpamọ́ tí a ṣe àtúnṣe pẹ̀lú àwọn ìlẹ̀kẹ̀ nano magnetic tí ó ní agbára gíga. DNA genomic máa ń so mọ́ àwọn ẹgbẹ́ tí ó ṣiṣẹ́ lórí ojú ilẹ̀ náà, a sì yà wọ́n sọ́tọ̀ lábẹ́ pápá magnetic òde. Lẹ́yìn ọ̀pọ̀ ìgbésẹ̀ fífọ díẹ̀ láti yọ àwọn protein, iyọ̀, àti àwọn àìmọ́ mìíràn kúrò, a yọ DNA genomic tí ó ní ìwẹ̀nùmọ́ gíga kúrò nígbẹ̀yìn gbẹ́yín.

A ṣe apẹrẹ rẹ̀ ní pàtó fún àwọn àpẹẹrẹ omi àyíká, ohun èlò náà ń yọ DNA bakitéríà tí a kó jọ sí àwọn àpò àlẹ̀mọ́, títí kan bakitéríà Gram-negative àti Gram-positive (tó tó 2 × 10⁹ àwọn sẹ́ẹ̀lì bakitéríà fún àpò àlẹ̀mọ́ kan ṣoṣo). Ó bá àwọn ètò ìyọkúrò nucleic acid aládàáṣe mu fún ṣíṣe iṣẹ́ gíga. DNA tí a yọ jáde jẹ́ dídára déédé, a sì lè lò ó tààrà fún PCR/qPCR, NGS, àti àwọn ohun èlò mìíràn tí ó wà ní ìsàlẹ̀.

Àwọn Ẹ̀yà Ọjà

1. Agbára Ìyọkúrò Bakteria Onípele-Broad-Spectrum

Ó ń yọ àwọn bakitéríà Gram-negative àti Gram-positive kúrò nínú àwọn àpẹẹrẹ omi, ó sì ń bo àwọn agbègbè microbial tí a sábà máa ń rí ní àyíká omi tútù àti omi, ó sì ń bá onírúurú ìbéèrè ìwádìí mu.

2. Ìmọ́tótó Gíga àti Ìṣẹ́dá Gíga

Ó ń pèsè DNA pẹ̀lú mímọ́ tó ga, láìsí àwọn ohun ìbàjẹ́ tí ó lè dí i lọ́wọ́, àti àwọn èso tí ó dúró ṣinṣin tí ó yẹ fún àwọn ohun èlò molecule tí ó wà ní ìsàlẹ̀.

3. Ibamu Adaṣiṣẹ ati Ṣiṣe-ṣiṣe Giga

Ó bá àwọn ètò ìyọkúrò nucleic acid aládàáṣe Bigfish mu ní ìbámu pẹ̀lú gbogbo rẹ̀, ó ń ṣe àtìlẹ́yìn fún ṣíṣe àyẹ̀wò àwọn àpẹẹrẹ 32 tàbí 96 ní àkókò kan náà, ó sì ń dín àkókò ṣíṣe àyẹ̀wò kù gan-an, ó sì ń mú kí iṣẹ́ yàrá sunwọ̀n sí i.

4. Iṣẹ́ tó dára àti tó rọrùn láti lò

Kò sí ìdí fún àwọn ohun èlò oní-ẹ̀rọ amúni-tó-májèlé bíi phenol tàbí chloroform, èyí tí ó dín ewu ààbò yàrá kù. A ti fi àwọn ohun èlò oní-ẹ̀rọ amúni-tó-májèlé sínú àwo 96 tí ó ní ihò, èyí tí ó ń dín àṣìṣe pípa omi ní ọwọ́ kù, tí ó sì ń mú kí iṣẹ́ ṣíṣe rọrùn.

Àwọn Ohun Èlò Tó Báramu

Ẹja Ńlá BFEX-16E

BFEX-32

BFEX-32E

BFEX-96E

Àwọn Àbájáde Ìdánwò

A fi àyẹ̀wò omi odò tí ó tó 600 mL ṣe àyẹ̀wò rẹ̀, a sì fi ohun èlò ìwẹ̀nùmọ́ DNA tí ó ní ìrísí Bigfish tí a fi ṣe àyíká omi Bigfish ṣe àgbékalẹ̀ rẹ̀ pẹ̀lú ohun èlò ìwẹ̀nùmọ́ tó báramu. Lẹ́yìn náà, a ṣe àyẹ̀wò DNA tí a yọ jáde nípa lílo agarose gel electrophoresis.

640 (1)

M: Àmì 1, 2: Àwọn àpẹẹrẹ omi odò

Àwọn Ìlànà Ọjà

640 (2)

Àkókò ìfìwéránṣẹ́: Oṣù Kejìlá-18-2025
Awọn eto ipamọ
Ṣàkóso Ìfọwọ́sí Kúkì
Láti fún wa ní àwọn ìrírí tó dára jùlọ, a máa ń lo àwọn ìmọ̀ ẹ̀rọ bíi kúkì láti tọ́jú àti/tàbí láti wo ìwífún nípa ẹ̀rọ. Fífún àwọn ìmọ̀ ẹ̀rọ wọ̀nyí láyè láti ṣe àgbékalẹ̀ dátà bíi ìwà wíwò tàbí àwọn ID àrà ọ̀tọ̀ lórí ojú-òpó wẹ́ẹ̀bù yìí. Àìgbàgbọ́ tàbí yíyọ ìfọwọ́sowọ́pọ̀ kúrò lè ní ipa búburú lórí àwọn ẹ̀yà ara àti iṣẹ́ kan.
✔ A gba
✔ Gba
Kọ́ kí o sì ti pa
X